栽培用テンサイ種子における遺伝子組換え体の検査法

1. 概要

本検査法は、栽培用テンサイの種子を検査対象とする。DNA抽出精製はGM quicker 2（ニッポンジーン社）を用い、1検体から2反復で実施する。抽出DNA試料中の目的遺伝子の有無を内在性遺伝子検出用プライマー対・プローブ及び組換え体由来遺伝子検出用プライマー対・プローブを用いたリアルタイムPCRで確認することにより、検体が遺伝子組換え体を含むか判定する。

2. 検査法

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3. 個別事項の説明

検査対象

和名：テンサイ
学名：Beta vulgaris L.

DNA抽出精製

ニッポンジーン社のGM quicker 2を使用。
緩衝液中に抽出したDNAをシリカゲル膜に吸着させ、不純物を取り除いた後、溶出。

PCRプライマー対及びプローブ

	名称	標的遺伝子	サイズ	遺伝子配列（注）
1	35Sプロモーター配列検知プライマー対・プローブ[1]	P35S	101bp	P35S-F：5’- ATT GAT GTG ATA TCT CCA CTG ACG T -3’ P35S-R：5’- CCT CTC CAA ATG AAA TGA ACT TCC T -3’ P35S-P：FAM 5’- CCC ACT ATC CTT CGC AAG ACC CTT CCT -3’ TAMRA
2	PFMVプロモーター配列検知プライマー対・プローブ[1]	PFMV	120bp	PFMV-F：5’- ATC AAC AAG GTA CGA GCC ATA TC -3’ PFMV-R：5’- TGA GGC TTT GGA CTG AGA ATT C -3’ PFMV-P：FAM 5’- CCA AGA AGG AAC TCC CAT CCT CAA AGG TTT -3’ TAMRA
3	テンサイ内在性GS遺伝子配列検知プライマー対・プローブ[2]	GluA3-F、GluA3-R及びGluD1	118bp	GluA3-F：5’- GAC CTC CAT ATT ACT GAA AGG AAG -3’ GluA3-R：5’- GAG TAA TTG CTC CAT CCT GTT CA -3’ GluD1-P：FAM 5’- CTA CGA AGT TTA AAG TAT GTG CCG CTC -3’ TAMRA

（注）F：フォワードプライマー、R：リバースプライマー、P：プローブ

使用したPCR機器及び反応条件

1)検査法の開発・確立に使用したPCR機器

Applied Biosystems 7900HT、Applied Biosystems 7500 （Applied Biosystems 社）

2)反応条件

50℃、2分間 → 95℃、10分間 → [95℃、15秒間 → 60℃、1分間] × 45cycles

3)PCR試薬

Taqman Universal PCR Master Mix 

妥当性確認

8試験機関による共同試験を実施。
1試験機関においては、3種類（GM濃度0％、0.05％及び0.1％）の試料を、1濃度につき7点分析。

GM濃度（％）（注1）	試料数	正答率（％）（注2）	誤答率（％）（注3）
0.1％	56	100％	0％
0.05％	56	100％	0％
0％	56	100％	0％

（注1）35Sプロモーターが導入された遺伝子組換えトウモロコシを該当濃度含有する。

（注2）GM濃度が0％の試料については陰性と判断した比率、それ以外の濃度の試料については陽性と判断した比率を示す。

（注3）GM濃度が0％の試料については偽陽性率、それ以外の濃度の試料については偽陰性率を示す。

検出下限

0.05％

農林水産省事業名

• 平成27年度 輸入栽培用種子中の未承認遺伝子組換え体検査対策事業（栽培用種子の未承認遺伝子組換え体検査法整備事業）
• 平成28年度 栽培用種子中の未承認遺伝子組換え体検査対策委託事業（栽培用種子の未承認遺伝組子換え体検査法整備及び確立事業）

参考資料

[1]Junichi Mano, Natsuki Shigemitsu, Satoshi Futo, Hiroshi Akiyama, Reiko Teshima, Akihiro Hino, Satoshi Furui and Kazumi Kitta,
    Real-Time PCR Array as a Universal Platform for the Detection of Genetically Modified Crops and Its Application in Identifying
    Unapproved Genetically Modified Crops in Japan 
    Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2009, 57(1), 26-37
[2]Joint Research Centre(JRC) GMO検査法データベース
    Event-specific method for the quantification of sugar beet line H7-1 using real-time PCR Protocol
    http://gmo-crl.jrc.ec.europa.eu/summaries/H7-1-validation%20report%20-%20corrected%20version%201.pdf