eMAFFに対応する薬機法（業許可、個人輸入等）の手続きについて

次期オンライン申請システム(eMAFF申請2.0)への移行について（動物薬事手続関係）

農林水産省共通申請サービス（eMAFF）は、令和8年10月1日（予定）から次期オンライン申請システム「eMAFF申請2.0」へ移行します。
動物用医薬品の業許可や個人輸入等に関する動物薬事手続については、現行のeMAFF申請による受付を令和8年10月21日をもって終了します。
令和8年10月22日以降は、eMAFF申請2.0をご利用ください。

なお、製造販売業、国内製造業、外国製造業及び修理業に係る以下の手続については、スケジュールが異なりますのでご注意ください。
電子納付等が使用できない期間は、お手数ですが書面申請＊1をお願いいたします。

1．新規申請
  対象：製造販売業、国内製造業、外国製造業及び修理業
  ・電子納付電子申請＊2
  ・アナログ納付電子申請＊3
  現行eMAFF申請での受付期限：令和8年9月2日まで

2．更新申請
  対象：製造販売業、国内製造業、外国製造業及び修理業
  ・電子納付電子申請
  現行eMAFF申請での受付期限：令和8年12月2日まで

3．eMAFF申請2.0での電子納付電子申請受付開始
  上記1及び2の手続きについては、令和9年4月1日（予定）から電子納付等による受付を開始します。
  新規申請については令和8年9月3日から令和9年3月31日までの間、更新申請については令和8年12月3日から令和9年3月31日までの間、電子納付等が利用できない期間については書面申請をご利用ください。

用語説明
  ＊1書面申請
    eMAFFを利用せず、必要書類を書面で提出して行う申請。
  ＊2電子納付電子申請
    電子納付を利用し、eMAFFによるオンライン申請を行う申請。
  ＊3アナログ納付電子申請
    eMAFFを利用して申請するものの、登録免許税等の納付は現金または収入印紙により行う申請。
    納付確認のため、領収書又は収入印紙を貼付した申請書の郵送が必要。

• eMAFF申請2.0説明会の開催について
  現行のeMAFFをご利用いただいている事業者の皆様を対象に、eMAFF申請2.0への移行に関する説明会を開催いたします。
  説明会では、eMAFF申請2.0における申請手順や、現行システムからの主な変更点等についてご説明します。
  参加を希望される方は、以下の申込フォームから令和8年8月21日（金曜日）までにお申し込みください。
  開催日時等の詳細につきましては、お申し込み時に登録いただいた連絡先へ後日ご案内いたします。
  
  ＜説明会申込フォーム＞
  eMAFF2.0移行における説明会について（外部リンク）
  
• 関連資料
  eMAFF2.0説明会案内(PDF : 310KB)
  eMAFF2.0への移行について
  

eMAFF申請2.0で受付可能な手続について

eMAFF申請2.0での申請受付が可能な手続きについては、以下の一覧をご確認ください。
一部の制度についてはeMAFF申請2.0から受付を廃止いたしますのでご注意ください。
eMAFF申請2.0_手続一覧(PDF : 126KB)

現行eMAFF申請との主な相違点は以下のとおりです。
・申請フォーム内で医薬品や医療機器等の種類を選択する形式にし、申請手続きを集約
・現行eMAFF申請で電子納付が可能な製造販売業、国内製造業、外国製造業及び修理業における新規及び更新申請について、アナログ納付申請の受付を廃止、電子納付申請のみに変更

なお、富山県では販売業のeMAFF申請を受け付けていないためご留意ください。（2026年7月31日時点）

農林水産省共通申請サービス(eMAFF)

eMAFFによる申請・届出の方法

eMAFFに対応する薬機法関連手続き一覧

製造販売業・(国内)製造業・外国製造業・販売業・修理業・その他

・製造販売業＊赤字は電子納付可能な手続

制度	手続の種別	名称	お問い合わせ窓口
動物薬事申請 (製造販売業)	新規	製造販売業の許可（医薬品等）	各都道府県の担当窓口 (こちらをご参照ください)
		製造販売業の許可（再生医療等製品）
		製造販売業の許可（医療機器等）
		製造販売業の許可（電子・医薬品等）
		製造販売業の許可（電子・再生医療等製品）
		製造販売業の許可（電子・医療機器等）
	更新	製造販売業の許可の更新（医薬品等）
		製造販売業の許可の更新（再生医療等製品）
		製造販売業の許可の更新（医療機器等）
		製造販売業の許可の更新（電子・医薬品等）
		製造販売業の許可の更新（電子・再生医療等製品）
		製造販売業の許可の更新（電子・医療機器等）
	書換	製造販売業の許可証の書換え交付（医薬品等）
		製造販売業の許可証の書換え交付（再生医療等製品）
		製造販売業の許可証の書換え交付（医療機器等）
	再交付	製造販売業の許可証の再交付（医薬品等）
		製造販売業の許可証の再交付（再生医療等製品）
		製造販売業の許可証の再交付（医療機器等）
	休廃止 再開	製造販売業の休止、廃止、再開（医薬品等）
		製造販売業の休止、廃止、再開（再生医療等製品）
		製造販売業の休止、廃止、再開（医療機器等）
	事項変更	製造販売業の許可関係事項の変更（医薬品等）
		製造販売業の許可関係事項の変更（再生医療等製品）
		製造販売業の許可関係事項の変更（医療機器等）

国内製造業＊赤字は電子納付可能な手続

制度	手続の種別		名称	お問い合わせ窓口
動物薬事申請 (国内製造業)	許可	新規	製造業の許可（医薬品等）	各都道府県の担当窓口 (こちらをご参照ください)
			製造業の許可（再生医療等製品）
			製造業の許可（電子・医薬品等）
			製造業の許可（電子・再生医療等製品）
		更新	製造業の許可の更新（医薬品等）
			製造業の許可の更新（再生医療等製品）
			製造業の許可の更新（電子・医薬品等）
			製造業の許可の更新（電子・再生医療等製品）
		書換	製造業の許可証の書換え交付（医薬品等）
			製造業の許可証の書換え交付（再生医療等製品）
		再交付	製造業の許可証の再交付（医薬品等）
			製造業の許可証の再交付（再生医療等製品）
	登録	新規	製造業の登録（医薬品等）
			製造業の登録（医療機器等）
			製造業の登録（電子・医薬品等）
			製造業の登録（電子・医療機器等）
		更新	製造業の登録の更新（医薬品等）
			製造業の登録の更新（医療機器等）
			製造業の登録の更新（電子・医薬品等）
			製造業の登録の更新（電子・医療機器等）
		書換	製造業の登録証の書換え交付（医薬品等）
			製造業の登録証の書換え交付（医療機器等）
		再交付	製造業の登録証の再交付（医薬品等）
			製造業の登録証の再交付（医療機器等）
	許可・登録 共通	区分変更	製造業の区分変更等（医薬品等）
			製造業の区分変更等（再生医療等製品）
		休廃止 再開	製造業の休止、廃止、再開（医薬品等）
			製造業の休止、廃止、再開（再生医療等製品）
			製造業の休止、廃止、再開（医療機器等）
		事項変更	製造業の許可（登録）関係事項の変更（医薬品等）
			製造業の許可関係事項の変更（再生医療等製品）
			製造業の登録関係事項の変更（医療機器等）

・外国製造業＊赤字は電子納付可能な手続

制度	手続の種別		名称	お問い合わせ窓口
動物薬事申請 (外国製造業)	認定	新規	外国製造業者の認定（医薬品等）	農林水産省消費・安全局 畜水産安全管理課薬事監視指導班 代表：03-3502-8111（内線4531） MAIL：yakuji_kanshi☆maff.go.jp 「☆」は「@」に置き換えて下さい (こちらをご参照ください)
			外国製造業者の認定（再生医療等製品）
			外国製造業者の認定（電子・医薬品等）
			外国製造業者の認定（電子・再生医療等製品）
		更新	外国製造業者の認定の更新（医薬品等）
			外国製造業者の認定の更新（再生医療等製品）
			外国製造業者の認定の更新（電子・医薬品等）
			外国製造業者の認定の更新（電子・再生医療等製品）
		書換	外国製造業者の認定証の書換え交付（医薬品等）
			外国製造業者の認定証の書換え交付（再生医療等製品）
		再交付	外国製造業者の認定証の再交付（医薬品等）
			外国製造業者の認定証の再交付（再生医療等製品）
	登録	新規	外国製造業者の登録（医療機器等）
			外国製造業者の登録（医薬品等）
			外国製造業者の登録（電子・医療機器等）
			外国製造業者の登録（電子・医薬品等）
		更新	外国製造業者の登録の更新（医薬品等）
			外国製造業者の登録の更新（医療機器等）
			外国製造業者の登録の更新（電子・医薬品等）
			外国製造業者の登録の更新（電子・医療機器等）
		書換	外国製造業者の登録証の書換え交付（医薬品等）
			外国製造業者の登録証の書換え交付（医療機器等）
		再交付	外国製造業者の登録証の再交付（医薬品等）
			外国製造業者の登録証の再交付（医療機器等）
	認定・登録 共通	区分変更	外国製造業者の認定区分変更等（医薬品等）
			外国製造業者の認定区分変更等（再生医療等製品）
		休廃止 再開	外国製造業の休止、廃止、再開（医薬品等）
			外国製造業の休止、廃止、再開（再生医療等製品）
			外国製造業の休止、廃止、再開（医療機器等）
		事項変更	外国製造業者の認定（登録）関係事項の変更（医薬品等）
			外国製造業者の認定関係事項の変更（再生医療等製品）
			外国製造業者の登録関係事項の変更（医療機器等）

・販売業

制度	手続の種別		名称	お問い合わせ窓口
動物薬事申請 (販売業)	医薬品販売業	新規	店舗販売業の許可	各都道府県の担当窓口 (こちらをご参照ください)
			卸売販売業の許可
			配置販売業の許可
			特例店舗販売業の許可
		更新	店舗販売業の許可の更新
			卸売販売業の許可の更新
			配置販売業の許可の更新
			特例店舗販売業の許可の更新
		その他	医薬品販売業の許可証の書換え交付
			医薬品販売業の許可証の再交付
			医薬品販売業の休止、廃止、再開
			医薬品販売業の許可関係事項の変更
			特例店舗販売業の許可における品目変更（追加指定）
	従事者関連	配置従事	配置従事の届出
			配置従事者の身分証明
		販売従事者	販売従事登録の申請
			販売従事登録の消除
			販売従事登録証の書換え交付
			販売従事登録証の再交付
		事項変更	登録販売者名簿登録事項変更届出
	医療機器	高度管理医療機器等	高度管理医療機器等の販売業等の許可
			高度管理医療機器等の販売業等の許可の更新
			高度管理医療機器等の販売業等の許可証の書換え交付
			高度管理医療機器等の販売業等の許可証の再交付
			高度管理医療機器等の販売業等の許可関係事項の変更
			高度管理医療機器の営業所の休止、廃止、再開
		管理医療機器	管理医療機器の販売業等の届出
			管理医療機器の販売業等の届出関係事項の変更
			管理医療機器営業所の休止、廃止、再開
	再生医療等製品関連		再生医療等製品の販売業の許可
			再生医療等製品の販売業の許可の更新
			再生医療等製品の販売業の許可証の書換え交付
			再生医療等製品の販売業の許可証の再交付
			再生医療等製品の販売業の休止、廃止、再開
			再生医療等製品の販売業の許可関係事項の変更

・修理業＊赤字は電子納付可能な手続

制度	手続の種別		名称	お問い合わせ窓口
動物薬事申請 (修理業)	医療機器	修理業	医療機器の修理業の許可	各農政局等の担当窓口 (農政局等一覧（PDF: 200KB）)
			医療機器の修理業の許可（電子）
			医療機器の修理業の許可の更新
			医療機器の修理業の許可の更新（電子）
			医療機器の修理業の許可の区分変更等
			医療機器の修理業の許可証の書換え交付
			医療機器の修理業の許可証の再交付
			医療機器の修理業の事業所の休止、廃止、再開
			医療機器の修理業の許可関係事項の変更

・その他

制度	手続の種別		名称	お問い合わせ窓口
動物薬事申請 (その他)	輸入確認		動物用医薬品の輸入確認	農林水産省消費・安全局 畜水産安全管理課薬事監視指導班 代表：03-3502-8111（内線4531） MAIL：yakuji_kanshi☆maff.go.jp 「☆」は「@」に置き換えて下さい
			動物用医療機器等の輸入確認
	回収の報告		回収の報告
	輸出用医薬品等		輸出用医薬品等の製造、輸出の届出	各都道府県の担当窓口 (こちらをご参照ください)
			輸出用医薬品等に関する届出事項変更の届出
			輸出用再生医療等製品の製造、輸出の届出
			輸出用再生医療等製品に関する届出事項変更の届出
			輸出用医療機器等の製造、輸出の届出
			輸出用医療機器等に関する届出事項変更の届出
	生物由来製品		生物由来製品の製造管理者の承認
			生物由来製品に関する記録及び届出の委託の届出
	再生医療等製品		再生医療等製品の製造管理者の承認
			再生医療等製品に関する記録及び届出の委託の届出
	輸出に係る証明書発行		動物用医薬品等の輸出に係る証明書（自由販売証明） それまでは「動物用医薬品等の輸出に係る証明書（GMP適合証明・BSE対策証明等）」から申請をお願いします。	各農政局等の担当窓口 (農政局等一覧(PDF: 200KB)）
			動物用医薬品等の輸出に係る証明書（GMP適合証明・BSE対策証明等）	農林水産省消費・安全局 畜水産安全管理課薬事監視指導班 代表：03-3502-8111（内線4531） MAIL：yakuji_kanshi☆maff.go.jp 「☆」は「@」に置き換えて下さい